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Escola de Biomatemática

Aqui você encontrará slides e outros materiais de apoio usados nas aulas

Dinâmica de uma população

Slides da aula 1

Bibliografia básica

Gotelli, N. 2007. Ecologia. Editora Planta. Capítulos 1 e 2 (Em inglês: A Primer of Ecology, 2008, Sinauer.)

Murray, Mathematical Biology I. An Introduction. Springer. Capítulo 1.

De Ross, A. 2019. Modeling Population Dynamics. Lecture notes. http://staff.science.uva.nl/~aroos/downloads/pdf_readers/syllabus.pdf

Para saber mais

Single-species models for many-species food webs: http://www.nature.com/nature/journal/v417/n6888/full/417541a.html

Edelstein-Keshet, L. Mathematical models in biology. Vol. 46. Siam, 1987.

Podani, J., Kun, Á. and Szilágyi, A., 2017. How Fast Does Darwin’s Elephant Population Grow?. Journal of the History of Biology, pp.1-23. Uma análise histórica e matemática da estimativa de crescimento de uma população de elefantes, que Darwin fez em seu livro “A origem das espécies”. Spoiler: Darwin errou.

Population dynamics from first principles. Capítulo 2 de: Complex Population Dynamics. Peter Turchin, Princeton Univ Press, 2003.

Predação

Slides da aula 2

Bibliografia básica

Gotelli, N. 2007. Ecologia. Editora Planta. Capítulo 6 (Em inglês: A Primer of Ecology, 2008, Sinauer.)

Murray, Mathematical Biology I. An Introduction. Springer. Capítulo 3.

Para saber mais
Clássicos

Ciclos limite em sistemas de predadores e presas, artigo original R.M. May: http://www.math.ku.dk/~moller/e04/bio/may72.pdf

O paradoxo do enriquecimento, artigo original de M. Rosenzweig: http://www.sciencemag.org/content/171/3969/385.full.pdf

O modelo Rosenzweig-MacArthur: The American Naturalist 97: 209-223 (1963)

Revisões

Roth II, T.C., Thaker, M. 2022. Predator-prey interaction, uma revisão da Oxford bibliographies.

Levin, S. 2009 (Ed.). The Princeton Guide to Ecology. Princeton University Press. Capítulos II.7, II.8, II.10, III.3.

Respostas funcionais

Jeschke, J. M., Kopp, M., & Tollrian, R. (2002). Predator functional responses: discriminating between handling and digesting prey. Ecological Monographs, 72(1), 95-112.

Interações de ordem superior

Abrams, P. A. 1983. Arguments in favor of higher order interactions. Am. Nat. 121, 887–891.

Billick, I. and Case, T.J., 1994. Higher order interactions in ecological communities: what are they and how can they be detected?. Ecology, 75(6), 1529-1543.Levin, S. 2009.

Predação e estruturação de comunidades e ecossistemas

Estes J.A. et al. 2011. Trophic Downgrading of Planet Earth. Science 333: 301-306.

Terborgh J. & Estes J.A. 2010. Trophic Cascades: Predators, Prey, and the Changing Dynamics of Nature. Island Press.

Predação intraguilda

Polis, G. A., Myers, C. A., & Holt, R. D. (1989). The ecology and evolution of intraguild predation: potential competitors that eat each other. Annual review of ecology and systematics, 297-330.

Competição

Slides da aula

Bibliografia básica

Gotelli, N. 2007. Ecologia. Editora Planta. Capítulo 5 (Em inglês: A Primer of Ecology, 2008, Sinauer.)

Murray, Mathematical Biology I. An Introduction. Springer. Capítulo 3.

Para saber mais
Clássicos

G.E. Hutchinson: Homage to Santa Rosalia, or are there so many kinds of animals: https://www.mtholyoke.edu/courses/srachoot/ecoevo/HomagetoSantaRosalia.pdf

G.E. Hutchinson: Concluding Remarks, http://artifex.org/~ecoreaders/lit/Hutchinson1957.pdf

G.F. Gause: Experimental studies on the struggle for existence: 1. Mixed population of two species of yeast http://jeb.biologists.org/content/9/4/389.full.pdf

MacArthur, R., & Levins, R. (1967). The limiting similarity, convergence, and divergence of coexisting species. American naturalist, 377-385.

Teoria moderna da coexistência

D. Tilman: Resource Competition and Community Structure. Google Books,amazon.com.

R.D. Holt: Apparent competition, http://people.biology.ufl.edu/rdholt/holtpublications/270.pdf

Chesson, P. (2000). Mechanisms of maintenance of species diversity. Annual review of Ecology and Systematics, 343-366.

Paradoxo do plâncton

G.E. Hutchinson: The paradox of the Plankton, http://cmore.soest.hawaii.edu/summercourse/2007/documents/paradox_of_the_plankton.pdf

Scheffer, Marten, et al. 2003. Why plankton communities have no equilibrium: solutions to the paradox. Hydrobiologia 491.1-3 : 9-18.

Li, L., & Chesson, P. 2016. The Effects of Dynamical Rates on Species Coexistence in a Variable Environment: The Paradox of the Plankton Revisited. The American Naturalist, 188(2), E46-E58.

Menden-Deuer, S. and Rowlett, J., 2014. Many ways to stay in the game: individual variability maintains high biodiversity in planktonic microorganisms. Journal of The Royal Society Interface, 11(95), 20140031.

Alexander, H., Jenkins, B.D., Rynearson, T.A. and Dyhrman, S.T., 2015. Metatranscriptome analyses indicate resource partitioning between diatoms in the field. Proceedings of the National Academy of Sciences, p.201421993.

Dinâmicas epidêmicas

Slides da aula

Bibliografia básica

Keeling, M.J. and Rohani, P. 2007. Modeling Infectious Diseases in Humans and Animals. Princeton.


Murray, Mathematical Biology I. An Introduction. Springer. Capítulo 10. Programas em http://www.modelinginfectiousdiseases.org


F. Brauer e C. Castillo-Chavez: Mathematical Models in Population Biology and Epidemiology (Springer, 2001)

Análise de bifurcação

Slides da aula

Exercício

Bibliografia básica

Ferrara, N. & Prado, C. 1995. Caos uma Introdução. Nelson Ferrara E Carmen do Prado, Editora Edgard Blücher


Monteiro, L. H. A. Sistemas Dinâmicos. 2011. Editora Livraria da Fisica.