Aqui você encontrará slides e outros materiais de apoio usados nas aulas
Dinâmica de uma população
Bibliografia básica
Gotelli, N. 2007. Ecologia. Editora Planta. Capítulos 1 e 2 (Em inglês: A Primer of Ecology, 2008, Sinauer.)
Murray, Mathematical Biology I. An Introduction. Springer. Capítulo 1.
De Ross, A. 2019. Modeling Population Dynamics. Lecture notes. http://staff.science.uva.nl/~aroos/downloads/pdf_readers/syllabus.pdf
Para saber mais
Single-species models for many-species food webs: http://www.nature.com/nature/journal/v417/n6888/full/417541a.html
Edelstein-Keshet, L. Mathematical models in biology. Vol. 46. Siam, 1987.
Podani, J., Kun, Á. and Szilágyi, A., 2017. How Fast Does Darwin’s Elephant Population Grow?. Journal of the History of Biology, pp.1-23. Uma análise histórica e matemática da estimativa de crescimento de uma população de elefantes, que Darwin fez em seu livro “A origem das espécies”. Spoiler: Darwin errou.
Population dynamics from first principles. Capítulo 2 de: Complex Population Dynamics. Peter Turchin, Princeton Univ Press, 2003.
Predação
Bibliografia básica
Gotelli, N. 2007. Ecologia. Editora Planta. Capítulo 6 (Em inglês: A Primer of Ecology, 2008, Sinauer.)
Murray, Mathematical Biology I. An Introduction. Springer. Capítulo 3.
Para saber mais
Clássicos
Ciclos limite em sistemas de predadores e presas, artigo original R.M. May: http://www.math.ku.dk/~moller/e04/bio/may72.pdf
O paradoxo do enriquecimento, artigo original de M. Rosenzweig: http://www.sciencemag.org/content/171/3969/385.full.pdf
O modelo Rosenzweig-MacArthur: The American Naturalist 97: 209-223 (1963)
Revisões
Roth II, T.C., Thaker, M. 2022. Predator-prey interaction, uma revisão da Oxford bibliographies.
Levin, S. 2009 (Ed.). The Princeton Guide to Ecology. Princeton University Press. Capítulos II.7, II.8, II.10, III.3.
Respostas funcionais
Jeschke, J. M., Kopp, M., & Tollrian, R. (2002). Predator functional responses: discriminating between handling and digesting prey. Ecological Monographs, 72(1), 95-112.
Interações de ordem superior
Abrams, P. A. 1983. Arguments in favor of higher order interactions. Am. Nat. 121, 887–891.
Billick, I. and Case, T.J., 1994. Higher order interactions in ecological communities: what are they and how can they be detected?. Ecology, 75(6), 1529-1543.Levin, S. 2009.
Predação e estruturação de comunidades e ecossistemas
Estes J.A. et al. 2011. Trophic Downgrading of Planet Earth. Science 333: 301-306.
Terborgh J. & Estes J.A. 2010. Trophic Cascades: Predators, Prey, and the Changing Dynamics of Nature. Island Press.
Predação intraguilda
Polis, G. A., Myers, C. A., & Holt, R. D. (1989). The ecology and evolution of intraguild predation: potential competitors that eat each other. Annual review of ecology and systematics, 297-330.
Competição
Bibliografia básica
Gotelli, N. 2007. Ecologia. Editora Planta. Capítulo 5 (Em inglês: A Primer of Ecology, 2008, Sinauer.)
Murray, Mathematical Biology I. An Introduction. Springer. Capítulo 3.
Para saber mais
Clássicos
G.E. Hutchinson: Homage to Santa Rosalia, or are there so many kinds of animals: https://www.mtholyoke.edu/courses/srachoot/ecoevo/HomagetoSantaRosalia.pdf
G.E. Hutchinson: Concluding Remarks, http://artifex.org/~ecoreaders/lit/Hutchinson1957.pdf
G.F. Gause: Experimental studies on the struggle for existence: 1. Mixed population of two species of yeast http://jeb.biologists.org/content/9/4/389.full.pdf
MacArthur, R., & Levins, R. (1967). The limiting similarity, convergence, and divergence of coexisting species. American naturalist, 377-385.
Teoria moderna da coexistência
D. Tilman: Resource Competition and Community Structure. Google Books,amazon.com.
R.D. Holt: Apparent competition, http://people.biology.ufl.edu/rdholt/holtpublications/270.pdf
Chesson, P. (2000). Mechanisms of maintenance of species diversity. Annual review of Ecology and Systematics, 343-366.
Paradoxo do plâncton
G.E. Hutchinson: The paradox of the Plankton, http://cmore.soest.hawaii.edu/summercourse/2007/documents/paradox_of_the_plankton.pdf
Scheffer, Marten, et al. 2003. Why plankton communities have no equilibrium: solutions to the paradox. Hydrobiologia 491.1-3 : 9-18.
Li, L., & Chesson, P. 2016. The Effects of Dynamical Rates on Species Coexistence in a Variable Environment: The Paradox of the Plankton Revisited. The American Naturalist, 188(2), E46-E58.
Menden-Deuer, S. and Rowlett, J., 2014. Many ways to stay in the game: individual variability maintains high biodiversity in planktonic microorganisms. Journal of The Royal Society Interface, 11(95), 20140031.
Alexander, H., Jenkins, B.D., Rynearson, T.A. and Dyhrman, S.T., 2015. Metatranscriptome analyses indicate resource partitioning between diatoms in the field. Proceedings of the National Academy of Sciences, p.201421993.
Dinâmicas epidêmicas
Bibliografia básica
Keeling, M.J. and Rohani, P. 2007. Modeling Infectious Diseases in Humans and Animals. Princeton.
Murray, Mathematical Biology I. An Introduction. Springer. Capítulo 10. Programas em http://www.modelinginfectiousdiseases.org
F. Brauer e C. Castillo-Chavez: Mathematical Models in Population Biology and Epidemiology (Springer, 2001)
Análise de bifurcação
Bibliografia básica
Ferrara, N. & Prado, C. 1995. Caos uma Introdução. Nelson Ferrara E Carmen do Prado, Editora Edgard Blücher
Monteiro, L. H. A. Sistemas Dinâmicos. 2011. Editora Livraria da Fisica.